Wyspy Archipelagu Japońskiego omywa pięć mórz - cztery zewnętrzne i jedno wewnętrzne. Morze Ochockie (Ohotsukukai) oblewa północne wybrzeża wyspy Hokkaido. Łączy się na południowym zachodzie z Morzem Japońskim poprzez cieśninę Soya. Wody terytorialne Japonii stanowi skrajnie południowy rejon morza. Morze Ochockie należy do najobfitszych w ryby mórz na kuli ziemskiej.

Morze Japońskie (Nipponkai), między łukiem głównych wysp a kontynentem Azji, oblewa wyspy Hokkaido i Honsiu od zachodu. Łączy się przez Cieśninę Tatarską i od północnego wschodu przez Cieśninę Soya z Morzem Ochockim, a przez Cieśninę Tsugaru z Pacyfikiem. Głębokość Morza Japońskiego wynosi około 4000 m.

Morze Wschodniochińskie (Toshinkai) oblewa zachodnie pobrzeże Kiusiu i cały łańcuch Wysp Południowo - Zachodnich.

Ocean Spokojny (Taiheiyo) oblewa wschodnie wybrzeża Wysp Japońskich na całej rozciągłości od północy do południa. Głębokość Pacyfiku w pobliżu Japonii jest w kilku miejscach bardzo duża; w pobliżu archipelagu Ogasawara dochodzi prawie do 9900 m.

Wewnętrzne Morze Japońskie (Seto - naikai) pomiędzy wyspami Honsiu na północy, a Sikoku i Kisiu na południu - czyli, zgodnie z japońską nazwą "morze wewnątrz cieśnin" - łączy się poprzez cieśniny Kii i Bungo z otwartym Pacyfikiem, a poprzez cieśninę Shimonoseki z Morzem Japońskim. W istocie rzeczy stanowi ono pięć mórz połączonych wzajemnie cieśninami. W swym najszerszym rejonie - od północy ku południu - mierzy 64 km, w najwęższym - 6,4 km. Pomiędzy Sikoku a Honsiu głębokość morza sięga tylko 70 m.
Żaden kraj na świecie nie jest tak zasobny w gorące i mineralne źródła jak Japonia. Większość tych źródeł (95 %) znajduje się w strefach wulkanicznych. M.in. słynne uzdrowisko Beppu na wyspie Kiusiu, w pólnocno - wschodnim rejonie wyspy nad zatoką Beppu.

Z powodu takiego ukształtowania powierzchni kraju, rzeki są krótkie i mają duże spadki z licznymi wodospadami. Najdłuższa jest Shinano (367 km). Japonia ma ponad 600 jezior, głównie pochodzenia wulkanicznego w kalderach i kraterach wygasłych wulkanów.

Największe z nich to jezioro Biwa na Honsiu. Pochodzenia wulkanicznego są także źródła mineralne, najczęściej termiczne, z których wiele ma właściwości lecznicze. Dzięki nim w Japonii istnieje ponad 1800 uzdrowisk. Na Kiusiu i Hokkaido licznie występują gejzery. [1]

Bibliografia
1. Warszyńska J. (red.), "Geografia turystyczna świata cz. 2", Warszawa 2000, s.82-90